모종의 사건을 겪게 된 후 사람들의 머리 위에 ‘플래그’가 보이게 된 소년 하타테 소우타. 도쿄 굴지의 명문교 사립 하타가야 학원에 전학 온 그는 ‘플래그’를 보는 능력 때문에 사람들과 거리를 두려고 하는데 왜 자꾸 미소녀들이 우글우글 모여드는 거야?! 심지어 남자 기숙사에 입주한 학생이 소우타밖에 없다는 사실을 알게 된 소녀를 포함해 다섯 명은 같이 살겠다고 나서는데?! 그에게 보이는 ‘플래그’는 대체 무엇을 뜻하는가? 또한 한 지붕 아래 살게 된 남자 한 명과 미소녀 다섯 명은 앞으로 어떻게 될지.